Model penting dalam mempelajari penyakit manusia, RNA non-coding dari genom anjing merupakan titik awal yang penting untuk studi evolusi dan biomedis, menurut sebuah studi baru yang dipimpin oleh The Genome Analisis Pusat (TGAC).
Penelitian baru yang dipublikasikan hari ini di PLoS ONE mengungkapkan anotasi peningkatan microRNAs dalam genom anjing untuk lebih memahami peran biologisnya. Menyediakan platform untuk studi masa depan dalam biomedis, evolusi dan domestikasi hewan penting termasuk anjing, sapi, kuda dan babi.
MicroRNAs (miRNAs) adalah molekul RNA non-coding kecil yang memainkan peran penting dalam mengatur ekspresi gen pada hewan dan tumbuhan. Menggunakan perakitan genom anjing terbaru dan urutan RNA kecil sembilan jaringan anjing yang berbeda termasuk kulit, darah, ovarium dan testis, ilmuwan dari TGAC telah mengidentifikasi 91 miRNAs baru.
Penemuan ini memberikan peluang yang sangat besar tidak hanya untuk meningkatkan pemahaman kita tentang bagaimana miRNAs mengatur berbagai proses biologis dalam spesies model penting untuk mempelajari penyakit manusia, tetapi dapat menyebabkan lebih lanjut, penelitian serupa ke dalam peran yang miRNAs bermain di domestikasi hewan.
Peneliti utama, Dr Luca Penso Dolfin dari TGAC ini Vertebrate & Kesehatan Genomics Group, mengatakan: "Sebagai miRNAs sangat penting dalam mendalangi berbagai proses seluler, penemuan 91 miRNAs ini baru menyediakan titik awal penting untuk mengeksplorasi efek berpotensi besar mereka di regulasi gen. "
Secara keseluruhan, 811 miRNAs dianalisis oleh Dr Penso-Dolfin: 91 Novel microRNA urutan dan 720 dilestarikan (yaitu, umum untuk organisme lain). Di antaranya lokus dilestarikan, 207 sebelumnya tidak pernah diidentifikasi sebagai microRNAs anjing.
Dr Penso-Dolfin, menambahkan: "Hasil kami menunjukkan peningkatan yang jelas dalam pengetahuan kita tentang genom anjing, membuka jalan untuk penelitian lebih lanjut pada evolusi regulasi gen, dan kontribusi microRNAs dengan kondisi patologis Kami sekarang melihat tambahan. Data untuk anjing dan berbagai hewan ternak, menggabungkan penemuan microRNA untuk penyelidikan peran mereka mungkin dalam domestikasi. "
Anjing domestik, Canis familiaris, adalah hasil dari serigala (Canis lupus) domestikasi, yang dimulai sekitar 10.000 tahun yang lalu. Sejak itu, ratusan ras anjing telah artifisial dipilih, yang mengarah ke tingkat yang sangat tinggi dari variasi morfologi dan perilaku. Setelah berbagi lingkungan dengan manusia sejak kemunculannya, anjing telah terkena patogen yang sama, dan karena itu merupakan sistem model penting untuk studi penyakit manusia.
Publikasi membangun genom Canine terbaru dan penjelasan, CanFam3.1 memberikan kesempatan untuk meningkatkan pemahaman kita tentang regulasi gen di jaringan dalam sistem model anjing.
Penelitian ini dipimpin oleh TGAC bekerjasama dengan Broad Institute, AS, dan Uppsala University, Swedia. Makalah berjudul: "An ditingkatkan penjelasan microRNA dari genom anjing" diterbitkan dalam PLoS ONE. Profesor Federica Di Palma, Direktur Sains di TGAC dan Dr Simon Moxon, Group Leader di Regulatory Genomics Group di TGAC adalah penulis yang sesuai bersama.
TGAC yang strategis didanai oleh BBSRC dan mengoperasikan Kemampuan Nasional untuk mempromosikan penerapan genomik dan bioinformatika untuk memajukan penelitian Bioscience dan inovasi.
from : https://www.sciencedaily.com